More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3560 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  100 
 
 		 377 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  61.85 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  58.63 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  58.67 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.14 
 
 		 409 aa  364  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.9 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.98 
 
 		 389 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.9 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.21 
 
 		 395 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  48.66 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.58 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.24 
 
 		 384 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.73 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  45.28 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.39 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.58 
 
 		 402 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  47.2 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.58 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.01 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.11 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.7 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.4 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.24 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.58 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.22 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  54.93 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.51 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.51 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.24 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.26 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.16 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.82 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.27 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.14 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.03 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.55 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  50 
 
 		 412 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  51.5 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.95 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.21 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  45.3 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  47.88 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.96 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  44.48 
 
 		 381 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  43.92 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  50.79 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  49.21 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  49.21 
 
 		 397 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.59 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  49.21 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  44.2 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  43.92 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  55.15 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  43.92 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.67 
 
 		 389 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  47.44 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  43.48 
 
 		 389 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  48.83 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.37 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.02 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  44.3 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.87 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.5 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.7 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.4 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  52.07 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  47.7 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  43.55 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.47 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  40.49 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  43.29 
 
 		 382 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  48.92 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 388 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.13 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  46.89 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  43.28 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  46.3 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  47.59 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  42.52 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 404 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>