More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2910 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 401 aa  775    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  64.97 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  63.54 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  62.41 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  61.99 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  61.99 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  61.99 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  60.15 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  59.28 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  58.76 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  59.38 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  62.4 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  58.61 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  60.82 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  58.55 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  56.44 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  57.4 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  58.76 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  57.47 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  58.25 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  57.36 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  58.72 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  54.64 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  56.36 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  57.51 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  53.3 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  57.04 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  56.23 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  55.35 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  58.44 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  58.67 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  58.55 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.04 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.79 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.27 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.19 
 
 		 398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  44.16 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.4 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.38 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.9 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.88 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.97 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.58 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.81 
 
 		 394 aa  279  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.72 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  51.32 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.38 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 396 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 380 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.83 
 
 		 392 aa  269  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.8 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.38 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.24 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.08 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.89 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.28 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.37 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.52 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  41.54 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.32 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  44.62 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  37.76 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.79 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  39.44 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  40.57 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.38 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.46 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>