More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1361 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  100 
 
 
407 aa  759    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  57.04 
 
 
412 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  56.7 
 
 
408 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  57.61 
 
 
401 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  56.78 
 
 
400 aa  359  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  54.64 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  52.96 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  50.51 
 
 
412 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  51.9 
 
 
422 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  54.36 
 
 
391 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  52.85 
 
 
384 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  52.59 
 
 
387 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  53.2 
 
 
388 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  51.79 
 
 
399 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  52.14 
 
 
418 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  52.69 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  52.69 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  52.69 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  52.74 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  53.21 
 
 
391 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  51.26 
 
 
413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  49.75 
 
 
397 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  50.13 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  50.27 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  49.87 
 
 
400 aa  312  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  50.53 
 
 
393 aa  308  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  48.87 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  53.06 
 
 
424 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  48.84 
 
 
390 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  51.77 
 
 
401 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  51.8 
 
 
408 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  46.59 
 
 
416 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.88 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  52.71 
 
 
391 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.05 
 
 
396 aa  279  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.66 
 
 
400 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.85 
 
 
384 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.53 
 
 
384 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.85 
 
 
400 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.86 
 
 
399 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.94 
 
 
392 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.05 
 
 
398 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 
392 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 
396 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.63 
 
 
394 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.86 
 
 
398 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.86 
 
 
398 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.03 
 
 
414 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.46 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.86 
 
 
399 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.13 
 
 
382 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.66 
 
 
394 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.67 
 
 
390 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.06 
 
 
400 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.2 
 
 
398 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  47.41 
 
 
381 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 
400 aa  245  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  38.82 
 
 
398 aa  246  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.37 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.53 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.78 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.17 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  37.89 
 
 
391 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.12 
 
 
1135 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.9 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.69 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.89 
 
 
381 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  41.34 
 
 
400 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.06 
 
 
409 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37.79 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  46.03 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.5 
 
 
402 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.49 
 
 
384 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.31 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.83 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.38 
 
 
402 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  39.18 
 
 
391 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.73 
 
 
396 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 
400 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  44.53 
 
 
390 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  37.53 
 
 
398 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.4 
 
 
388 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.43 
 
 
389 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.4 
 
 
401 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  44.74 
 
 
390 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  39.07 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  36.18 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  46.63 
 
 
381 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  39.47 
 
 
402 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.18 
 
 
389 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.09 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.51 
 
 
1143 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.07 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  39.18 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18960  cysteine desulfurase family protein  46.55 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.477328  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.18 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  42.27 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.53 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>