More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2049 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  100 
 
 
402 aa  825    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  51.17 
 
 
382 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  48.68 
 
 
379 aa  351  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  47.63 
 
 
389 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  48.68 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  45.33 
 
 
375 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  45.72 
 
 
375 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  41.71 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  43.98 
 
 
382 aa  295  7e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  42.37 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  44.09 
 
 
380 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  44.09 
 
 
380 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.85 
 
 
381 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 
392 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.63 
 
 
398 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.9 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.13 
 
 
396 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.32 
 
 
383 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.58 
 
 
381 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.56 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  39.69 
 
 
380 aa  252  8.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  40 
 
 
384 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.68 
 
 
400 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  41.36 
 
 
398 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  36.83 
 
 
404 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.79 
 
 
384 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0830  cysteine desulphurase  38.98 
 
 
376 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.73 
 
 
383 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  40 
 
 
384 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  38.79 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.79 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.2 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  38.96 
 
 
394 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
381 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.68 
 
 
396 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.29 
 
 
382 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  37.73 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  37.73 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
381 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.46 
 
 
380 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.48 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
384 aa  245  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
381 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  39.16 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  37 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.67 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  38.52 
 
 
381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.69 
 
 
400 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  37.67 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.23 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.23 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.73 
 
 
402 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.21 
 
 
407 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.4 
 
 
384 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.7 
 
 
383 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.68 
 
 
380 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  38.26 
 
 
381 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
404 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.52 
 
 
394 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  38.26 
 
 
381 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  37.82 
 
 
392 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  39.84 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  39.79 
 
 
382 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
381 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  39.74 
 
 
406 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.01 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
404 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
404 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  37.96 
 
 
404 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  38.58 
 
 
409 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.24 
 
 
394 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.14 
 
 
400 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  38.39 
 
 
404 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.24 
 
 
394 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  36.87 
 
 
381 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  38.3 
 
 
406 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  37.92 
 
 
417 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  37.88 
 
 
400 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  37.65 
 
 
404 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.03 
 
 
396 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  37.53 
 
 
411 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  38.03 
 
 
403 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  38.89 
 
 
371 aa  235  8e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  37.28 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>