More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0616 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  100 
 
 		 408 aa  801    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  48.29 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  48.66 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  51.44 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  50.91 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  49.34 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  46.32 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  51.18 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  51.18 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  47.24 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.66 
 
 		 403 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.55 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  48.55 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.02 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.55 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.55 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.55 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  48.81 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  48.68 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.42 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  47.93 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  51.45 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  48.05 
 
 		 406 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  47.89 
 
 		 406 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  47.41 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  47.64 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  48.05 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  46.89 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  48.38 
 
 		 507 aa  352  7e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  47.41 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  47.12 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.76 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  47.12 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 404 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  48.27 
 
 		 502 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  48.57 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  47.79 
 
 		 411 aa  348  9e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 404 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  46.97 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 		 414 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  46.7 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  48.03 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  46.44 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  49.08 
 
 		 417 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.72 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  46.72 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.63 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 403 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  48.29 
 
 		 404 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  46.86 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  46.98 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  47.24 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  46.93 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.15 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  47.69 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.14 
 
 		 417 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  46.19 
 
 		 406 aa  332  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  47.66 
 
 		 407 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  45.14 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  45.19 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  46.79 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>