More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1444 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  79.86 
 
 
414 aa  694    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  100 
 
 
417 aa  852    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  73.68 
 
 
407 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  73.43 
 
 
407 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  73.18 
 
 
407 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  71.93 
 
 
407 aa  620  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  71.68 
 
 
407 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  71.68 
 
 
407 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  71.68 
 
 
407 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  70.93 
 
 
405 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  71.18 
 
 
407 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  70.93 
 
 
407 aa  614  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  71.18 
 
 
407 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  71.18 
 
 
407 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  69.92 
 
 
405 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  69.92 
 
 
405 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  70.18 
 
 
405 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  69.19 
 
 
406 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  68.67 
 
 
407 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  69.67 
 
 
403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  71.57 
 
 
406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  69.5 
 
 
405 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  69.17 
 
 
407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  71.32 
 
 
408 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  71.25 
 
 
405 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  71.07 
 
 
407 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  70.93 
 
 
406 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  70.68 
 
 
406 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  68.67 
 
 
419 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  70.18 
 
 
402 aa  591  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  69.92 
 
 
406 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  68.92 
 
 
419 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  69.42 
 
 
406 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  71.54 
 
 
403 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  69.67 
 
 
406 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  68.67 
 
 
405 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  68.42 
 
 
411 aa  585  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  67.67 
 
 
430 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  67.92 
 
 
405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  68.08 
 
 
436 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  68.08 
 
 
403 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  67.33 
 
 
407 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  68.67 
 
 
406 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  67.58 
 
 
403 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  68.08 
 
 
436 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  68.33 
 
 
407 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  67.92 
 
 
406 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  65.84 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  65.84 
 
 
404 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  65.84 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  67.33 
 
 
405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  65.09 
 
 
404 aa  571  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  64.59 
 
 
404 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  63.84 
 
 
404 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  64.34 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  65.59 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  66.08 
 
 
404 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  64.09 
 
 
404 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  65.84 
 
 
404 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  66.33 
 
 
404 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
409 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  64.53 
 
 
421 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  65.09 
 
 
409 aa  551  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  64.53 
 
 
407 aa  551  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  63.84 
 
 
404 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
409 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  65.84 
 
 
404 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  63.84 
 
 
404 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  65.34 
 
 
404 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  64.66 
 
 
403 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  63.09 
 
 
404 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  64.84 
 
 
404 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  66.58 
 
 
404 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  63.09 
 
 
406 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>