More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0566 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  100 
 
 		 771 aa  1603    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  61.44 
 
 		 778 aa  989    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  68 
 
 		 761 aa  1080    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  70.52 
 
 		 759 aa  1142    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  56.66 
 
 		 753 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  33.86 
 
 		 384 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.1 
 
 		 384 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  34.74 
 
 		 396 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  34.12 
 
 		 398 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.75 
 
 		 400 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  34.92 
 
 		 402 aa  207  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 398 aa  207  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  33.59 
 
 		 407 aa  207  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 401 aa  206  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  34.21 
 
 		 393 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  34.93 
 
 		 379 aa  205  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  32.93 
 
 		 400 aa  204  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  35.92 
 
 		 391 aa  204  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.82 
 
 		 401 aa  204  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 382 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  32 
 
 		 394 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  32.31 
 
 		 383 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  36.22 
 
 		 391 aa  200  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.01 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  35.64 
 
 		 390 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  32.28 
 
 		 401 aa  198  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  34.66 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  31.66 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.8 
 
 		 396 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 382 aa  197  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  34.04 
 
 		 400 aa  197  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  33.6 
 
 		 391 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  31.65 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 380 aa  195  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0304  aminotransferase, class V  35.5 
 
 		 395 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  32.04 
 
 		 386 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  32.19 
 
 		 398 aa  194  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 382 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  31.81 
 
 		 392 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  32.01 
 
 		 398 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  32.13 
 
 		 385 aa  193  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 390 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  35.17 
 
 		 400 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  35.43 
 
 		 380 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  31.65 
 
 		 381 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  31.88 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  35.25 
 
 		 383 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  33.59 
 
 		 400 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  30.95 
 
 		 414 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  32.88 
 
 		 381 aa  191  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  32.02 
 
 		 391 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  34.52 
 
 		 407 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 380 aa  190  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  30.69 
 
 		 381 aa  190  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 380 aa  190  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  31.89 
 
 		 380 aa  190  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  32.73 
 
 		 380 aa  190  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 388 aa  190  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  32.45 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  31.44 
 
 		 382 aa  190  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 380 aa  189  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  32.01 
 
 		 389 aa  189  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  32.81 
 
 		 387 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  32.56 
 
 		 381 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  33.51 
 
 		 399 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  32.73 
 
 		 380 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 380 aa  188  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  188  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 400 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  31.54 
 
 		 384 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  30.99 
 
 		 381 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  31.75 
 
 		 389 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 389 aa  187  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  32.77 
 
 		 410 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  31.94 
 
 		 400 aa  187  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  32.21 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  34.47 
 
 		 407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  32.15 
 
 		 381 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  30.69 
 
 		 388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  34.13 
 
 		 394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  31.28 
 
 		 384 aa  185  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  32.04 
 
 		 402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  35.48 
 
 		 382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  32.9 
 
 		 392 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  33.78 
 
 		 401 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  33.78 
 
 		 401 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>