More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1001 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2871  Cysteine desulfurase  73.08 
 
 		 509 aa  775    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  100 
 
 		 508 aa  1037    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 394 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.72 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.17 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 382 aa  319  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.65 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.95 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 392 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.43 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.06 
 
 		 394 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  42.46 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.67 
 
 		 396 aa  307  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.46 
 
 		 414 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.8 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.52 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.33 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 404 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  45.05 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.11 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.27 
 
 		 403 aa  302  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.52 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.6 
 
 		 395 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  45.97 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.95 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.47 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.18 
 
 		 384 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  44.09 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1477  putative cysteine desulfurase  44.36 
 
 		 408 aa  299  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.339117  hitchhiker  0.000732384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.91 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.63 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  44.62 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 404 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 380 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  43.34 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  43.84 
 
 		 388 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  42.52 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.27 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 404 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 405 aa  296  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  43.59 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  44.84 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 406 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  42.19 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.27 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.36 
 
 		 393 aa  293  6e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.12 
 
 		 388 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.04 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.74 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 404 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  42.22 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.18 
 
 		 382 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 404 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  40.26 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  42.15 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  41.73 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  40.66 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  41.51 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.9 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  40.92 
 
 		 421 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  40.68 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.42 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  40.42 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  41.82 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>