More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0544 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  61.41 
 
 		 778 aa  988    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  68 
 
 		 771 aa  1075    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 759 aa  1053    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  100 
 
 		 761 aa  1585    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  57.88 
 
 		 753 aa  864    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  32.46 
 
 		 384 aa  214  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 384 aa  211  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 396 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  32.99 
 
 		 382 aa  198  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  34.84 
 
 		 402 aa  197  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  31.73 
 
 		 381 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  36.68 
 
 		 390 aa  197  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.73 
 
 		 400 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 380 aa  196  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  36.96 
 
 		 390 aa  195  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 386 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  32.11 
 
 		 398 aa  195  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 380 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 384 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  33.25 
 
 		 380 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  31.68 
 
 		 392 aa  194  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  31.11 
 
 		 398 aa  193  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  32.27 
 
 		 382 aa  193  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  31.71 
 
 		 400 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  32.98 
 
 		 380 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  34.97 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  35.98 
 
 		 400 aa  191  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  30.86 
 
 		 401 aa  191  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 400 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.68 
 
 		 398 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  30.41 
 
 		 382 aa  190  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  36.13 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 373 aa  189  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  35.09 
 
 		 391 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  189  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 387 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  33.25 
 
 		 400 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 379 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 398 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  32.71 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 377 aa  187  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  31.83 
 
 		 407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  32.56 
 
 		 508 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  30.69 
 
 		 383 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  32.44 
 
 		 380 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  31.89 
 
 		 393 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  30.1 
 
 		 394 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  31.9 
 
 		 380 aa  185  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  31.83 
 
 		 380 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  32.1 
 
 		 391 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 391 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  32.23 
 
 		 403 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  29.48 
 
 		 414 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  33.42 
 
 		 381 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  30.12 
 
 		 401 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  35.37 
 
 		 407 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 407 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  32.81 
 
 		 389 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  30.93 
 
 		 388 aa  183  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 400 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  32.07 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.23 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  32.99 
 
 		 389 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  32.91 
 
 		 385 aa  181  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  31.81 
 
 		 388 aa  181  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  29 
 
 		 394 aa  180  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  29.75 
 
 		 398 aa  180  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  30.59 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 400 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  36.96 
 
 		 390 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 380 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  29.6 
 
 		 397 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  32.28 
 
 		 402 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  33.08 
 
 		 382 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  32.74 
 
 		 408 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  30.95 
 
 		 390 aa  178  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  33.94 
 
 		 401 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0304  aminotransferase, class V  31.33 
 
 		 395 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3007  aminotransferase, class V  32.91 
 
 		 378 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  29.04 
 
 		 384 aa  177  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  34.64 
 
 		 399 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  34.22 
 
 		 397 aa  177  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  31.13 
 
 		 389 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  29.95 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 409 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  30.43 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 381 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  28.79 
 
 		 384 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  30 
 
 		 373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  34.04 
 
 		 388 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  29.34 
 
 		 414 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  31.28 
 
 		 381 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>