More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5849 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  100 
 
 		 391 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  85.42 
 
 		 391 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  68.8 
 
 		 390 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  68.29 
 
 		 390 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  68.8 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  65.8 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  49.1 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  47.7 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  48.93 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  51.7 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  48.21 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  48.83 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  45.93 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  51.3 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.24 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  46.67 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.24 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.95 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.75 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  46.32 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.79 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  48.33 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.35 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  47.27 
 
 		 412 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  48.31 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 1139 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.79 
 
 		 1135 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.22 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.5 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.99 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.78 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.23 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.74 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.81 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.04 
 
 		 1143 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  39.05 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.19 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.17 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  37.08 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  41.75 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.34 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.21 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  42.74 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.62 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.06 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.73 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  43.6 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  45.6 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  41.32 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.4 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.7 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  40.52 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.54 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.77 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.1 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.18 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.04 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  34.74 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.39 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  37.86 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.46 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.28 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  41.89 
 
 		 397 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.62 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.74 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  32.48 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  38.96 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  36.68 
 
 		 402 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  38.96 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  43.36 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  36.9 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.85 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  38.24 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  39.23 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.08 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>