More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0693 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  100 
 
 		 389 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  72.94 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  70.1 
 
 		 390 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  70.1 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  65.8 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  69.17 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 393 aa  328  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  48.46 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  47.8 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 392 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  49.09 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  50 
 
 		 388 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  48.53 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  45 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.27 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.29 
 
 		 396 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  48.63 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 424 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  49.2 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.3 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.93 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.46 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.37 
 
 		 414 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.38 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.66 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  48.43 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.71 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.39 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.33 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.23 
 
 		 396 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  42.38 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  44.79 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.58 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.4 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.72 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  36.71 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.64 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  38.76 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  36.93 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.15 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.92 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.74 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.02 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  45.66 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  38.86 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.17 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  46.61 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  39.32 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.22 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.34 
 
 		 1135 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  43.98 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  45.53 
 
 		 373 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  46.88 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.22 
 
 		 1139 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  44.58 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.9 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.66 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.21 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  44.29 
 
 		 1143 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.6 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  41.67 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.85 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  43.88 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.82 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.23 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  39.4 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  39.4 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  39.4 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  39.4 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.54 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.21 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  43.57 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.56 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>