More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2884 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  100 
 
 		 373 aa  748    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  56.87 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  54.82 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  55.04 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  55.26 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  54.96 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  49.73 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.24 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.26 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.89 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  50.55 
 
 		 1143 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  43.4 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 1139 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 1135 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.43 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.32 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  48.54 
 
 		 393 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.54 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.25 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.24 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.29 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.9 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.8 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.54 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.4 
 
 		 389 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  45.43 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.89 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  43.94 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  43.78 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.32 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.74 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.63 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.01 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.74 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  42.97 
 
 		 397 aa  285  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  42.33 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  43.55 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  43.55 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 		 394 aa  281  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  44.17 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.7 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.26 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  42.2 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  43.7 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.74 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  42.12 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  48.95 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.41 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.25 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  42.59 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  46.32 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.53 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.41 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.24 
 
 		 402 aa  275  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  42.06 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.78 
 
 		 393 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 389 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  44.41 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  44.32 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.62 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  44.54 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.86 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 384 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.81 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.81 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  44.54 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.55 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  42.09 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  46.77 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  43.85 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.31 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  44.35 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  41.78 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  45.58 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.28 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>