More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2206 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  100 
 
 
387 aa  759    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  64.77 
 
 
385 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  54.35 
 
 
382 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  55.01 
 
 
385 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  55.23 
 
 
373 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  48.94 
 
 
385 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  48.2 
 
 
393 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.67 
 
 
384 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
384 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.7 
 
 
382 aa  297  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  49.59 
 
 
1143 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.16 
 
 
392 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  49.33 
 
 
1135 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 
388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.91 
 
 
383 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.97 
 
 
386 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.38 
 
 
400 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.14 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.32 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  41.9 
 
 
397 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.27 
 
 
379 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  49.72 
 
 
1139 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.54 
 
 
382 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.27 
 
 
394 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 
402 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.37 
 
 
388 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  41.93 
 
 
400 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.93 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.8 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39.85 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.59 
 
 
401 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  44.85 
 
 
383 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
394 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.85 
 
 
404 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.1 
 
 
398 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.84 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.85 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.73 
 
 
384 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.36 
 
 
401 aa  269  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.67 
 
 
389 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.33 
 
 
398 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.96 
 
 
414 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.84 
 
 
398 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.15 
 
 
399 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.58 
 
 
383 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 
403 aa  265  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.33 
 
 
409 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  46.35 
 
 
390 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  39.48 
 
 
402 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.13 
 
 
389 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40.58 
 
 
383 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  44.41 
 
 
390 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  43.24 
 
 
388 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  39.95 
 
 
405 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.86 
 
 
398 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  42.75 
 
 
395 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  43.3 
 
 
400 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  40.21 
 
 
403 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.1 
 
 
396 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.9 
 
 
398 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  41.15 
 
 
402 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.6 
 
 
404 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.48 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.06 
 
 
380 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  40.76 
 
 
394 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  40.48 
 
 
400 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  37.21 
 
 
386 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  43.3 
 
 
410 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.69 
 
 
391 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 
404 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  44.33 
 
 
492 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  39.64 
 
 
391 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.86 
 
 
393 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  42.2 
 
 
388 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  41.67 
 
 
388 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  41.62 
 
 
389 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.12 
 
 
396 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.63 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.6 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  45.94 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.82 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  43.55 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  46.45 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  44.05 
 
 
395 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  44.86 
 
 
392 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.85 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  39.39 
 
 
394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  37.56 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  41.84 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  41.84 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  38.34 
 
 
389 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  39.95 
 
 
389 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.51 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  41.58 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.05 
 
 
404 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  37.57 
 
 
373 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  39.74 
 
 
404 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.11 
 
 
396 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  40.85 
 
 
393 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>