More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0675 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  784    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  57.55 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  54.97 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  55.01 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  55.26 
 
 		 373 aa  358  9e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  45.99 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.26 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.31 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.6 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.16 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.28 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.74 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 394 aa  282  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.26 
 
 		 1143 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.99 
 
 		 1135 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.72 
 
 		 1139 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.9 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.88 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.47 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  41.67 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  43.52 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.85 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  39.31 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.43 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.66 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.64 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  38.56 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.25 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.9 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  41.45 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  41.45 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  40.1 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.86 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  40.1 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.18 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.16 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.31 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  38.6 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.52 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.12 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  43.49 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  42.74 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.86 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.36 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  39.06 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.05 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.92 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.43 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  40.37 
 
 		 379 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  38.5 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  42.71 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  43.38 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.5 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  38.7 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.27 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  38.7 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  38.9 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.22 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  38.08 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.75 
 
 		 401 aa  248  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  38.18 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.76 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.64 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.18 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>