More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0304 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  100 
 
 
530 aa  1099    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.62 
 
 
533 aa  371  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  40.24 
 
 
492 aa  361  2e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  42.9 
 
 
378 aa  297  3e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  37.84 
 
 
400 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  38.07 
 
 
383 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  38.24 
 
 
391 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.53 
 
 
393 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  37.43 
 
 
385 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  38.87 
 
 
386 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  37.57 
 
 
391 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  37 
 
 
390 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  38.77 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  35.03 
 
 
387 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  38.92 
 
 
392 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  37.71 
 
 
368 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  38.07 
 
 
373 aa  213  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  37.17 
 
 
386 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  37.6 
 
 
385 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  37.8 
 
 
390 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  36.72 
 
 
394 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.62 
 
 
394 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  34.93 
 
 
401 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  36.19 
 
 
396 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  34.93 
 
 
401 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  36.53 
 
 
382 aa  206  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  35.12 
 
 
390 aa  206  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  32.56 
 
 
392 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.84 
 
 
384 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  34.49 
 
 
401 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  34.31 
 
 
400 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  34.95 
 
 
399 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  35.01 
 
 
1139 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.77 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  38.13 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  34.49 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  34.49 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  35.85 
 
 
398 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  38.01 
 
 
399 aa  200  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  35.03 
 
 
1143 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  34.68 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  37.87 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  34.58 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  35.12 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  36.07 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  34.29 
 
 
405 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  35.51 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  34.67 
 
 
403 aa  197  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  35.96 
 
 
400 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  32.53 
 
 
388 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  35.2 
 
 
391 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  36.9 
 
 
385 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  37.11 
 
 
387 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  34.32 
 
 
393 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  31.59 
 
 
418 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0593  aminotransferase class V  36.68 
 
 
389 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  35.86 
 
 
387 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  35.39 
 
 
410 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  35.32 
 
 
387 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  33.42 
 
 
400 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  35.86 
 
 
388 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  34.63 
 
 
401 aa  193  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  34.57 
 
 
404 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  35.75 
 
 
397 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  35.58 
 
 
379 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  34.29 
 
 
387 aa  193  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  33.78 
 
 
399 aa  193  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  38.13 
 
 
380 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.05 
 
 
398 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  35.87 
 
 
389 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  34.04 
 
 
400 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  34.78 
 
 
382 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  33.51 
 
 
381 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  35.87 
 
 
389 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  34.49 
 
 
383 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  33.42 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  35.26 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0643  aminotransferase class V  35.58 
 
 
387 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  34.49 
 
 
393 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  34.83 
 
 
419 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  34.89 
 
 
383 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  32.04 
 
 
412 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  35 
 
 
400 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  34.22 
 
 
393 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  32.98 
 
 
1135 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  32.8 
 
 
387 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  34.75 
 
 
402 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  34.48 
 
 
391 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  34.68 
 
 
390 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.03 
 
 
394 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.42 
 
 
392 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  32.7 
 
 
407 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  34.22 
 
 
396 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  34.32 
 
 
388 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  35.64 
 
 
391 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  35.22 
 
 
392 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  34.75 
 
 
378 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  34.03 
 
 
393 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.51 
 
 
414 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  33.61 
 
 
402 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>