More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8687 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 399 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0593  aminotransferase class V  64.91 
 
 		 389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  43.85 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.54 
 
 		 403 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.28 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.77 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.86 
 
 		 400 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.74 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  45.7 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0109  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  46.04 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.78 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.49 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.63 
 
 		 394 aa  269  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.33 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  42.59 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.47 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.94 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  45.53 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.06 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  41.02 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.62 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  42.43 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  43.21 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  43.21 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.09 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.33 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.68 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.31 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.33 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.63 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  43.12 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.51 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.75 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.16 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.05 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.42 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 394 aa  259  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  38.95 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  42.56 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  38.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.34 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  38.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.11 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  46.75 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.8 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.14 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  48.43 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.44 
 
 		 398 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  44.21 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  40.43 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  38.68 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.64 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  40.97 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  37.63 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.05 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.89 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  38.95 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.11 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  36.51 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.6 
 
 		 1143 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>