More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0643 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0643  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 404 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  37.37 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.43 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.21 
 
 		 402 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.19 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  36.06 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.26 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  38.3 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  36.06 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.7 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.66 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  35.14 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.94 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.36 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  36.02 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  35.39 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.14 
 
 		 1143 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.96 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.76 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  37.95 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  36.32 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  36.76 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  36.76 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  38.12 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  33.52 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 389 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  37.04 
 
 		 385 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.22 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.95 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  35.58 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.59 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  33.84 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  37.44 
 
 		 1139 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  37.27 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  37.27 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  38.15 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  38.4 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  33.76 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.87 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.25 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.33 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  37.2 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  38.12 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  36.68 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.37 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  34.66 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  37.05 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  34.86 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  36.62 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  34.02 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  35.37 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  37.3 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  35.6 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  35.98 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  33.98 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 1135 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  36.56 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  38.11 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  35.99 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.81 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  36.92 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  39.34 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  35.89 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  36.61 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  31.98 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  34.47 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  34.96 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  35.7 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  35.7 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  38.25 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  35.58 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  33.83 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04685  putative NIFS-like protein  39.39 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  36.61 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  38.71 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>