More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1506 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  54.15 
 
 		 778 aa  847    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  57.88 
 
 		 761 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  56.66 
 
 		 771 aa  875    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  58.23 
 
 		 759 aa  882    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  100 
 
 		 753 aa  1551    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  35.96 
 
 		 380 aa  208  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  35.96 
 
 		 380 aa  208  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  33.77 
 
 		 384 aa  206  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 380 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 384 aa  204  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  34.65 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  34.76 
 
 		 380 aa  201  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  35.83 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  35.03 
 
 		 380 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  198  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 380 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 414 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 373 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  34.31 
 
 		 383 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 380 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.81 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.36 
 
 		 384 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  35.43 
 
 		 400 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 401 aa  194  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.47 
 
 		 396 aa  194  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  34.79 
 
 		 386 aa  194  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  36.99 
 
 		 382 aa  194  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  32.98 
 
 		 400 aa  193  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  33.79 
 
 		 407 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 382 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  33.51 
 
 		 398 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 398 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 390 aa  190  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3007  aminotransferase, class V  34.88 
 
 		 378 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  32.64 
 
 		 397 aa  190  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  36.53 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  34.1 
 
 		 385 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  33.95 
 
 		 388 aa  188  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  36.07 
 
 		 400 aa  188  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  32.11 
 
 		 401 aa  188  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  34.49 
 
 		 391 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.54 
 
 		 401 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  33.69 
 
 		 391 aa  187  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 381 aa  187  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  35.7 
 
 		 410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  32.38 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  32.8 
 
 		 382 aa  186  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  37.89 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.96 
 
 		 399 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  30.32 
 
 		 381 aa  185  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  32.19 
 
 		 398 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  32.43 
 
 		 381 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  34.22 
 
 		 402 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 408 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  35.97 
 
 		 408 aa  184  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  32.02 
 
 		 387 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  35.79 
 
 		 392 aa  183  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  36.13 
 
 		 407 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  34.05 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 389 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  30.99 
 
 		 395 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  35.37 
 
 		 391 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  32.53 
 
 		 377 aa  182  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  34.6 
 
 		 387 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  34.05 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  35.5 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  32.74 
 
 		 380 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.34 
 
 		 398 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  36.64 
 
 		 393 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3207  Cysteine desulfurase  32.91 
 
 		 380 aa  181  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2029  Cysteine desulfurase  34.11 
 
 		 381 aa  181  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.243371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  30.26 
 
 		 381 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  34.09 
 
 		 384 aa  181  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  35.47 
 
 		 385 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  35.66 
 
 		 391 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  31.84 
 
 		 398 aa  180  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  30.83 
 
 		 382 aa  180  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 392 aa  180  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0835  aminotransferase class V  37.13 
 
 		 377 aa  180  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.723233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  33.25 
 
 		 381 aa  180  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  32.85 
 
 		 400 aa  180  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.89 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 388 aa  180  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  31.28 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  31.83 
 
 		 381 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2786  cysteine desulfurase  38.38 
 
 		 378 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  36.05 
 
 		 388 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>