More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3207 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3207  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 380 aa  787    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 396 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 388 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.41 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.53 
 
 		 382 aa  292  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.37 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  43.98 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  40.32 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.19 
 
 		 392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.9 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  44.23 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.74 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  41.39 
 
 		 502 aa  282  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.06 
 
 		 417 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.86 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.88 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.68 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  42.7 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 389 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.05 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 384 aa  275  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  43.37 
 
 		 493 aa  274  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  39.42 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  41.3 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.94 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.84 
 
 		 388 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  42.12 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  41.47 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.32 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.79 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.84 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.94 
 
 		 1143 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 1139 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.73 
 
 		 383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  39.63 
 
 		 403 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  39.63 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.78 
 
 		 396 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  39.05 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  39.16 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  39.05 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  39.63 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  39.63 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  39.43 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  39.31 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  40.68 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  40.27 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.42 
 
 		 398 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  39.84 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0830  cysteine desulphurase  40.43 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  40.47 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2472  aminotransferase, class V  40.77 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  37.47 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  41.51 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  38.58 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  38.58 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  41.32 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.73 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.79 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.44 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  40.36 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.05 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  39.55 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  38.9 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>