More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0835 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0835  aminotransferase class V  100 
 
 		 377 aa  773    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.723233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2786  cysteine desulfurase  71.01 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2472  aminotransferase, class V  58.82 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0169  cysteine desulfurase DndA  51.97 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.07 
 
 		 388 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.18 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.92 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  42.71 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.32 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  40.92 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  42.82 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.35 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  43.65 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  40.92 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  45.18 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  43.85 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  44.54 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 407 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.22 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.43 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  41.18 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  41.95 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  43.7 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.18 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.13 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  42.19 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.06 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 403 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.95 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.95 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  43.84 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  43.32 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  42.22 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  44.35 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.38 
 
 		 507 aa  259  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  42.39 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  41.74 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.29 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  43.35 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  41.76 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  42.94 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  42.02 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  42.23 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  43.3 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  43.22 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  42.11 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  40.86 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  43.24 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  41.22 
 
 		 406 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  43.05 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.3 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>