More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1841 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  100 
 
 		 384 aa  784    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  47.67 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  49.58 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  46.3 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.42 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.91 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.54 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  47.19 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  49.17 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  48.02 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  47.34 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4569  aminotransferase, class V  49.12 
 
 		 388 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  45.63 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  46.67 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  44.85 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  45.38 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  46.41 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  46.41 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.81 
 
 		 507 aa  308  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  45.38 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.82 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  47.75 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  47.75 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.9 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  45.22 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  44.68 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  50.28 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.14 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 407 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.4 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.79 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.27 
 
 		 409 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  47.47 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  46.39 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  44.94 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  44.94 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  45.86 
 
 		 407 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.09 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.11 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.09 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.11 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.5 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.83 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  47.08 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  44.94 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.37 
 
 		 388 aa  298  7e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.8 
 
 		 389 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.71 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.05 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  42.98 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  41.74 
 
 		 402 aa  294  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  45.22 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  44.41 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  44.41 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.06 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.53 
 
 		 404 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.24 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  44.51 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  44.94 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  44.69 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  44.51 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.8 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  44.51 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  42.48 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  45.81 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  44.13 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  48.21 
 
 		 354 aa  289  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>