More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2429 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  100 
 
 		 354 aa  701    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  72.52 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  62.67 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  57.18 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  59.83 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  59.54 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  49.15 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01991  NifS-like aminotransferase class-V  49.86 
 
 		 381 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.117256  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0172  nifS-like aminotransferase class-V  48.88 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01881  NifS-like aminotransferase class-V  48.59 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  55.31 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  53.76 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  51.01 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  50 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  50.71 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  50.14 
 
 		 388 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  49.17 
 
 		 399 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.04 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.04 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.2 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  47.06 
 
 		 404 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.06 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  46.2 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  45.69 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  46.55 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.37 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  47.89 
 
 		 408 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  46.78 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 422 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.61 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  47.9 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  46.57 
 
 		 405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.03 
 
 		 403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  46.22 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  45.85 
 
 		 405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.26 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.03 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.26 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.03 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  47.06 
 
 		 402 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  47.47 
 
 		 430 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 407 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  46.48 
 
 		 403 aa  302  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  46.69 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.63 
 
 		 406 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  45.4 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  48.15 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  45.98 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  44.82 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  46.97 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  46.7 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  46.5 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 404 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  47.35 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  48.03 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  46.42 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.4 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  45.51 
 
 		 407 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  45.51 
 
 		 407 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  45.51 
 
 		 407 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.51 
 
 		 407 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.51 
 
 		 407 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  45.53 
 
 		 404 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  46.24 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  44.82 
 
 		 507 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  46.31 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.98 
 
 		 410 aa  296  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  46.22 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  46.69 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  45.07 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  47.08 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>