More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2109 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2109  NifS-like aminotransferase class-V  100 
 
 		 354 aa  707    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2429  NifS-like aminotransferase class-V  72.52 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0534136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  63.84 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01881  NifS-like aminotransferase class-V  53.8 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  59.54 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  58.96 
 
 		 382 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01991  NifS-like aminotransferase class-V  48.88 
 
 		 381 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.117256  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0172  nifS-like aminotransferase class-V  46.63 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  48.14 
 
 		 381 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01881  NifS-like aminotransferase class-V  47.56 
 
 		 381 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.25 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  52.51 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  51.15 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  46.93 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  50.29 
 
 		 388 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  48.31 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  48.6 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  45.43 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  48.28 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  47.13 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  47.41 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  47.7 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  46.07 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  47.55 
 
 		 406 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  45.89 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  44.6 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  46.11 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.69 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.7 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.4 
 
 		 404 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.26 
 
 		 404 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 406 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  48.31 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.4 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 422 aa  293  2e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  44.38 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  45.38 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  46.11 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  44.54 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.5 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  44.54 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  44.63 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  44.25 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  44.25 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.38 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  45.48 
 
 		 403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  46.11 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  45.94 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.66 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  44.38 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  44.66 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  48.51 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  44.9 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.07 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.11 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  45.98 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  45.01 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  45.35 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  45.35 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  44.66 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  43.23 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.35 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  44.38 
 
 		 411 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.7 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  43.84 
 
 		 405 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.83 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>