More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2786 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2786  cysteine desulfurase  100 
 
 		 378 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0835  aminotransferase class V  71.01 
 
 		 377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.723233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2472  aminotransferase, class V  56.8 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0169  cysteine desulfurase DndA  53.56 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 407 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.77 
 
 		 407 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  44.89 
 
 		 407 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  44.89 
 
 		 407 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 407 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  43.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  43.28 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  43.28 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.9 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.05 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  42.9 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  42.59 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  45.58 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  43.94 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  42.9 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  42.9 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.51 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.55 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  42.9 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  43.55 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  42.63 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.37 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  43.16 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  43.28 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 406 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  47.07 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  42.32 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.58 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  44.74 
 
 		 414 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  42.63 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  42.47 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  42.63 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  41.76 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  43.43 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 411 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1477  putative cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.339117  hitchhiker  0.000732384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  41.51 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  40.8 
 
 		 404 aa  269  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  39.11 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  42.63 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  42.74 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  39.11 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  40.32 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  43.12 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.67 
 
 		 405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  41.55 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.81 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  42.7 
 
 		 493 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>