More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3334 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  100 
 
 
245 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  84.68 
 
 
248 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  54.43 
 
 
361 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  52.7 
 
 
232 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.52 
 
 
230 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.52 
 
 
230 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  50.22 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  51.5 
 
 
242 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  50.22 
 
 
229 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
229 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.59 
 
 
239 aa  228  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  51.08 
 
 
232 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  51.07 
 
 
249 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  51.49 
 
 
229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
250 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.92 
 
 
230 aa  218  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  47.41 
 
 
250 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  47.21 
 
 
249 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  48.28 
 
 
228 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  49.79 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  47.3 
 
 
258 aa  214  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  50.81 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  47.3 
 
 
244 aa  211  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  48.93 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  45.23 
 
 
346 aa  208  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  45.68 
 
 
357 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  46.06 
 
 
344 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 
250 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  46.75 
 
 
250 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  46.75 
 
 
250 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  43.91 
 
 
229 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  44.4 
 
 
346 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  44.81 
 
 
345 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 
356 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  45.92 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 
356 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.76 
 
 
357 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  43.97 
 
 
250 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 
356 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  45.92 
 
 
356 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  43.72 
 
 
233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  43.72 
 
 
233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  39.83 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.16 
 
 
233 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  39.41 
 
 
235 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.95 
 
 
346 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.81 
 
 
354 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  35.27 
 
 
319 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  33.83 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
297 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
202 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 
294 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  33.58 
 
 
294 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
215 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 
294 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  34.7 
 
 
294 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 
294 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
294 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 
294 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 
292 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  35.07 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  33.7 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
289 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  32 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 
288 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
294 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  34.19 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  34.32 
 
 
299 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
287 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  33.82 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  32.09 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  34.66 
 
 
297 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 
308 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
444 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  31.39 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  33.58 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.09 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.05 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
459 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
459 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
301 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
297 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>