More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2821 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  38.39 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 361 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  36.11 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  35.65 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  33.79 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 356 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  39.81 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.12 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 		 356 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  39.35 
 
 		 356 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 		 356 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.28 
 
 		 357 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 357 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 		 346 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  30.95 
 
 		 346 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  30.7 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  30.89 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  30.95 
 
 		 345 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  28.99 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  31.66 
 
 		 250 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 344 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 250 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  33.03 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  26.07 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  26.07 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  29.44 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.68 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.26 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  29.77 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.14 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  31.78 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.64 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  28.72 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.64 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  26.45 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  31.05 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.95 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  26.37 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  27.98 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  27.43 
 
 		 426 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.32 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>