More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0246 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  68.54 
 
 
213 aa  318  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  65.73 
 
 
213 aa  297  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  64.62 
 
 
226 aa  288  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  60.09 
 
 
213 aa  284  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  63.38 
 
 
215 aa  279  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  58.96 
 
 
218 aa  262  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
220 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
214 aa  131  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
202 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.32 
 
 
346 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 
242 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.9 
 
 
233 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  33.65 
 
 
346 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  39.89 
 
 
251 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.23 
 
 
235 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.47 
 
 
480 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.79 
 
 
213 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
459 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.42 
 
 
354 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
459 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  31.09 
 
 
235 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  30.93 
 
 
235 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
459 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.24 
 
 
459 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
459 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.7 
 
 
226 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  33 
 
 
228 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
209 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.65 
 
 
346 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
459 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 
345 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.68 
 
 
209 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 
464 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
209 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
470 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  35.94 
 
 
229 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.52 
 
 
201 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.6 
 
 
479 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
209 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
251 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.92 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
459 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
617 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 
471 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 
467 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  32.17 
 
 
450 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
462 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.97 
 
 
471 aa  97.8  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  31.08 
 
 
456 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  32.42 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 
467 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  32.7 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
472 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.67 
 
 
472 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
470 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
471 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
453 aa  95.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  33.48 
 
 
459 aa  94.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  33.01 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 
460 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.74 
 
 
207 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
469 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 
470 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
208 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  35.47 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.54 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
344 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32 
 
 
455 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.13 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
464 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
229 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  31.19 
 
 
229 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
461 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.97 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  29.72 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  31.48 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.9 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3533  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
272 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>