More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2674 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  76.44 
 
 
209 aa  338  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  72.25 
 
 
251 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  61.06 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  61.35 
 
 
207 aa  268  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  58.65 
 
 
209 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  58.65 
 
 
209 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  53.85 
 
 
210 aa  241  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  52.63 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  48.06 
 
 
210 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  51.21 
 
 
205 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  47.34 
 
 
205 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  45.1 
 
 
213 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  44.98 
 
 
207 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 
211 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  42.79 
 
 
223 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  46.41 
 
 
213 aa  175  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
214 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  43 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 
214 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 
220 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
214 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
214 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  44.61 
 
 
213 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  39.13 
 
 
218 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
209 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 
218 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  40.29 
 
 
222 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 
213 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  41.83 
 
 
214 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  41.06 
 
 
218 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.38 
 
 
209 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  44.88 
 
 
213 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  40.57 
 
 
215 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.71 
 
 
216 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  43.41 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  37.98 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 
218 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
221 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
214 aa  161  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 
214 aa  161  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  43.94 
 
 
213 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 
210 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
216 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
214 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  38.1 
 
 
213 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 
214 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 
217 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 
215 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 
214 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 
215 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 
215 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 
215 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 
215 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 
215 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 
215 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
214 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
215 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.05 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
215 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
215 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
205 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38.57 
 
 
213 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  39.05 
 
 
206 aa  154  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 
212 aa  154  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
215 aa  154  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  40.38 
 
 
222 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  36.84 
 
 
215 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
215 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  36.84 
 
 
215 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
212 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  153  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  40.87 
 
 
217 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  39.62 
 
 
212 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 
215 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  40.78 
 
 
224 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  38.28 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
211 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
235 aa  151  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>