More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2853 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  63.73 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  62.44 
 
 		 209 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  64.08 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  53.62 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  51.96 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  41.06 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  41.06 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.86 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.98 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  39.61 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  40.58 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  36.06 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  37.2 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.87 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.82 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.13 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  39.52 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.39 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.22 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  37.98 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  38.28 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.44 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.55 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.65 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  39.36 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  34.65 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.91 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.91 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.63 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.13 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 303 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.32 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>