More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1241 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  76.6 
 
 		 236 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  64.68 
 
 		 236 aa  314  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  61.37 
 
 		 237 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  60.68 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  59.4 
 
 		 238 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  59.4 
 
 		 238 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  58.97 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  57.69 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  39.04 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  34.76 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.09 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.25 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.21 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  34.43 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.9 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.55 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.73 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  41.05 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  35.41 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  35.53 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.8 
 
 		 354 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  35.75 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 198 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 		 209 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.6 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.3 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 		 376 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  31.28 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.38 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  31.65 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 374 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  31.43 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 484 aa  98.6  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 466 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  32.67 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.54 
 
 		 346 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.32 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.41 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 382 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 476 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.84 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  31.94 
 
 		 432 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 464 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 203 aa  95.1  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 444 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 469 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 444 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.1 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  33.67 
 
 		 308 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  29.95 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.12 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 302 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>