More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5123 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  91.18 
 
 
262 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  88.66 
 
 
238 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  88.66 
 
 
238 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  88.66 
 
 
238 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  84.19 
 
 
237 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  68.09 
 
 
236 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  63.68 
 
 
236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  57.69 
 
 
237 aa  289  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 
237 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.07 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.93 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 
214 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  34.36 
 
 
206 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  34.36 
 
 
206 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
202 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.83 
 
 
211 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
213 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  34.55 
 
 
213 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.57 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.61 
 
 
209 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
206 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
213 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  38.62 
 
 
254 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 
209 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 
207 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 
226 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  27.36 
 
 
235 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.36 
 
 
235 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
212 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
209 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 
251 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
205 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
198 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.51 
 
 
354 aa  99.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
382 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.78 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  34.59 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.47 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.79 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  32.49 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  37.68 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.68 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  28.94 
 
 
345 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.51 
 
 
361 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.36 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
298 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.41 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  45.16 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 
346 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.26 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.68 
 
 
215 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.12 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
344 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.71 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  29.29 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  29.13 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  32.42 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.65 
 
 
201 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.57 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 
195 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
484 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.61 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  29.36 
 
 
346 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
210 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 
215 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>