More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1123 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  47.34 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  45.93 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  42.58 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  42.58 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  43.06 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  38.94 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 		 209 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  46.89 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  45.59 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.63 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  44.61 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.31 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  44.61 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  44.28 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  43.69 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  43.84 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  41.35 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  40.87 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.93 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.9 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.23 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  42.03 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  41.83 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  41.38 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  41.18 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  41.71 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  42.72 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  40.89 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  39.81 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  48.31 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 		 235 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  40.49 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.42 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.63 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  42.23 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  41.75 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.94 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>