More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0418 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  53.77 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  48.34 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  47.42 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  43.13 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  44.95 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  40.85 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  40.09 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  41.31 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  45.63 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  41.78 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  41.78 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  40.57 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  40.57 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  43.69 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  39.44 
 
 		 241 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.62 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.44 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  39.44 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  39.44 
 
 		 237 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.95 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  40.85 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  40.85 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  44.12 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  41.95 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 303 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.79 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  40.09 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.03 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  40 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.89 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.62 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.74 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  38.03 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  37.07 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.14 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  38.92 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  38.6 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  42.16 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.32 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  40.49 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>