More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1123 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  76.44 
 
 		 209 aa  338  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  70.53 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  62.8 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  61.72 
 
 		 209 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  58.45 
 
 		 207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  61.24 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  56.04 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  55.24 
 
 		 207 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  49.03 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  49.52 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  48.04 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  45.71 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  48.79 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  45.93 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.98 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  43.96 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  39.71 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  42.92 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  39.23 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  40.67 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  40.67 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  41.62 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  40.61 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  43.07 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  42.16 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.14 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.14 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  43.75 
 
 		 205 aa  157  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  39.71 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.02 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  42.79 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  39.13 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  43 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  36.06 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  40.3 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  37.32 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>