More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3119 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  66.19 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  66.99 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  66.82 
 
 		 224 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  65.24 
 
 		 216 aa  297  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  64.79 
 
 		 214 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  66.35 
 
 		 214 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  66.19 
 
 		 214 aa  293  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  66.19 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  65.71 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  65.71 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  65.71 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  65.71 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  65.71 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  64.95 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  63.38 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  63.38 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  63.38 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  63.38 
 
 		 214 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  64.29 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  64.49 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  66.82 
 
 		 483 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  63.21 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  63.38 
 
 		 214 aa  284  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  62.86 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  62.91 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  62.2 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  63.03 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  61.9 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  64.45 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  61.43 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  59.62 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  62.8 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  62.32 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  62.32 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  60.29 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  59.35 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  60.95 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  58.29 
 
 		 214 aa  270  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 		 214 aa  267  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  57.01 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  58.1 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  58.49 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  60.1 
 
 		 212 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  60.87 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  56.4 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  54.93 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  56.87 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 		 214 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 		 214 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  60.87 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  58.1 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  55.45 
 
 		 215 aa  258  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  54.46 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  56.07 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  54.98 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  55.45 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  57.21 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 214 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  56.54 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  54.03 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  56.74 
 
 		 218 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  54.03 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.45 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.45 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.13 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.45 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.45 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.45 
 
 		 215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  51.64 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0660  metallo-beta-lactamase family protein  63.81 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.548963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  54.5 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  55.71 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  53.55 
 
 		 215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  57.21 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  53.55 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  53.55 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  53.55 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  53.55 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.08 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  53.55 
 
 		 215 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  52.61 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  52.61 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  53.08 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  53.08 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  53.08 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  56.19 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  55.24 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  52.61 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  57.43 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  53.85 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  56.31 
 
 		 222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  50.71 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  54.76 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  55.34 
 
 		 222 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  55.34 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.93 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>