More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1902 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  98.54 
 
 
206 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  47.57 
 
 
205 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  49.51 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  49.03 
 
 
206 aa  187  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  45.33 
 
 
212 aa  175  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.38 
 
 
214 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  40.1 
 
 
207 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  42.93 
 
 
210 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.67 
 
 
209 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
213 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 
251 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
209 aa  164  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42.93 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 
205 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  42.5 
 
 
198 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
215 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 
215 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.67 
 
 
211 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.96 
 
 
215 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
215 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  39.29 
 
 
224 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.96 
 
 
215 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 
215 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
215 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 
215 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
215 aa  158  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  40.72 
 
 
222 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  40.72 
 
 
222 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  40.72 
 
 
222 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.78 
 
 
207 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
208 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  39.42 
 
 
222 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  40.09 
 
 
209 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  39.09 
 
 
231 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
215 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
214 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  39.72 
 
 
237 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 
214 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.05 
 
 
209 aa  154  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 
211 aa  154  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 
214 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
216 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
215 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
207 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  40.28 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.33 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.28 
 
 
214 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.32 
 
 
222 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 
215 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.33 
 
 
215 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
215 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.65 
 
 
214 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 
214 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
213 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
214 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 
214 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  41.23 
 
 
212 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 
214 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 
214 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  39.72 
 
 
214 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 
213 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  39.42 
 
 
230 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
214 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 
214 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 
214 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 
212 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
221 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.48 
 
 
212 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
214 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  37.73 
 
 
231 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  38.79 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  34.84 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  39.51 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>