More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3707 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  45.63 
 
 
210 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 
209 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 
207 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  44.06 
 
 
207 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  44.93 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  44 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  43.06 
 
 
209 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  45.19 
 
 
214 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.78 
 
 
211 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 
209 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
210 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  42.23 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 
206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  43.41 
 
 
213 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 
214 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
217 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  43.63 
 
 
213 aa  157  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 
214 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  40.87 
 
 
209 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  41.55 
 
 
219 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  43.27 
 
 
213 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 
214 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.95 
 
 
214 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  44.23 
 
 
222 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 
212 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 
213 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 
218 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
205 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 
213 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  41.63 
 
 
207 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  40.48 
 
 
214 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  39.9 
 
 
207 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 
218 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
206 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  40.76 
 
 
214 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
204 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
214 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 
210 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  40.67 
 
 
213 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
235 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  44.06 
 
 
206 aa  148  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  39.32 
 
 
241 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 
214 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
214 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
214 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 
211 aa  147  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  39.5 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  39.32 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  40.29 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.55 
 
 
222 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  40.29 
 
 
222 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
215 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 
209 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 
208 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  40.78 
 
 
224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 
237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  40.29 
 
 
216 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  37.21 
 
 
218 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
214 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 
222 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
212 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
214 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
214 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
216 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  38.71 
 
 
224 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 
216 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
215 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
215 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
215 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.81 
 
 
212 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.54 
 
 
215 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
214 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
215 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
214 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 
218 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
214 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  141  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
215 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>