More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3014 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  44.08 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  46.45 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  43.13 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.07 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.62 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  37.25 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.14 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.24 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  38.24 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  36.76 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.44 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.44 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.54 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.95 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.95 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.95 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.95 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.95 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.47 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  35.12 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.75 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  39.32 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  35.07 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.32 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  37.14 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  38.54 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  35.61 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  35.78 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>