More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1306 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
213 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  41.63 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 
212 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  41.71 
 
 
212 aa  174  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
213 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.91 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
210 aa  148  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 
215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39 
 
 
213 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
207 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
210 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
209 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.69 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.67 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
209 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  38 
 
 
215 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 
215 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
213 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.69 
 
 
209 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.5 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
210 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
209 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
212 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 
209 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
213 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
212 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.07 
 
 
207 aa  131  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.5 
 
 
208 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
240 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  35.15 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  35.47 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36 
 
 
241 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
215 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
210 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.02 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 
217 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.55 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 
209 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.29 
 
 
212 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  37.75 
 
 
214 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
208 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
214 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  35.5 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.58 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
215 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
215 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
215 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 
215 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.76 
 
 
218 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.78 
 
 
216 aa  124  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  34.95 
 
 
212 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.55 
 
 
215 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.55 
 
 
215 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
211 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.55 
 
 
215 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>