More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1731 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  54.11 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  54.23 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  51.96 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  54.85 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  41.75 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  41.75 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  41.55 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  41.55 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  41.55 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.41 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.19 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38.16 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  38.73 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  37.68 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.74 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  37.62 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.12 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  38.65 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  37.13 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.34 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.44 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.41 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  39.56 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.37 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.89 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.96 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  35.24 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  34.76 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  37.25 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  38.81 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.24 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.71 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  39.59 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>