More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0198 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  73.33 
 
 
210 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 
209 aa  244  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  53.11 
 
 
209 aa  234  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  53.11 
 
 
209 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  52.63 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  52.15 
 
 
209 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  52.15 
 
 
209 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  52.15 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  52.15 
 
 
209 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  51.67 
 
 
209 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  52.63 
 
 
208 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  52.63 
 
 
208 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 
215 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.67 
 
 
211 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  44.71 
 
 
210 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
205 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  39.55 
 
 
225 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
207 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
207 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 
210 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 
234 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 
231 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  40.28 
 
 
213 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
233 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
231 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
198 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  40.83 
 
 
229 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.34 
 
 
214 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  41.83 
 
 
219 aa  148  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
216 aa  148  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  37.95 
 
 
224 aa  147  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  39.63 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  39.71 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
205 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
206 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
245 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 
212 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
205 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
211 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
206 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 
209 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
204 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
206 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
215 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 
209 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.73 
 
 
213 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
212 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
210 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  40.19 
 
 
208 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  35.21 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  38.35 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  40 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  41.04 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 
246 aa  138  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.38 
 
 
215 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 
215 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
208 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 
214 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.38 
 
 
215 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.94 
 
 
207 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  35.1 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.78 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  36.06 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.1 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 
215 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  39.01 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
215 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 
215 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
212 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
214 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
214 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
231 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 
214 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.54 
 
 
207 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
240 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  37.07 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 
215 aa  134  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 
212 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  34.6 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  40.67 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  36.59 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  37.2 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>