More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3235 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  48.6 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  48.34 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  46.45 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.74 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.16 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  37.09 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.58 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.05 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.38 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.19 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.19 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.89 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  38.28 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.68 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.76 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  36.18 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  36.89 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  39.07 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.68 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  36.18 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.71 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.11 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  34.11 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>