More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4155 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  53.77 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  50.47 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  49.05 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  40.38 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  39.9 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41.92 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.7 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  36.67 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 		 219 aa  137  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36.68 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.72 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  35.12 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.45 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  38 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  34.47 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.11 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  35.75 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  37.02 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.8 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.55 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.26 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.47 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.82 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.47 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.47 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  36.76 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  35.12 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.85 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  35.15 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>