More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2261 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  51.44 
 
 
211 aa  194  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 
204 aa  190  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 
215 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
214 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 
213 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
213 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  43.13 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  43.07 
 
 
209 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 
214 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
214 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
207 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  39.81 
 
 
209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
212 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  39.81 
 
 
209 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.81 
 
 
209 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
213 aa  157  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  43.2 
 
 
214 aa  157  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 
213 aa  157  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
209 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
209 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.55 
 
 
209 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 
209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 
209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
208 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
208 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
208 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
209 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  43.46 
 
 
214 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 
217 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  37.44 
 
 
213 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 
251 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
215 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
215 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
210 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
235 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.5 
 
 
215 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 
205 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
205 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.94 
 
 
215 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
215 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 
218 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
215 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  43.93 
 
 
234 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  41.4 
 
 
231 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
210 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
209 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  38.14 
 
 
215 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 
219 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  38.76 
 
 
224 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.65 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.61 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 
213 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
214 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
216 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
214 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
215 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.23 
 
 
209 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
205 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
212 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 
214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.05 
 
 
214 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
215 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  38.46 
 
 
222 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  38.18 
 
 
230 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 
245 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  42.33 
 
 
231 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  39.05 
 
 
214 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
214 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 
214 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36.79 
 
 
241 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  38.16 
 
 
222 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  37.68 
 
 
222 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 
229 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.35 
 
 
212 aa  141  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>