More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1700 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  63.83 
 
 		 229 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  59.66 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  61.34 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  60.96 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  60.45 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  58.47 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  57.66 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  54.27 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  62.21 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  51.84 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  52.74 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  54.05 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  54.05 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  54.05 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  51.34 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  51.13 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  48.89 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.07 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.38 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 205 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 205 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 209 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  43.93 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  39.17 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  39.17 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  38.32 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.32 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.9 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  39.91 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.65 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.07 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.61 
 
 		 206 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.59 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  42.99 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  41.23 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.78 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.25 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 		 215 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  36.45 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  42.25 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  36.45 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  37.56 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  39.25 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.92 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.98 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  39.63 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.74 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  44.04 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  39.27 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>