More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1342 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  46 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  47.5 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  50 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  45.5 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.27 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  45.1 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  45.92 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  47.76 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  45.27 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  43.41 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  41.41 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  40.89 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 198 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  38.5 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  39 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.19 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.61 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.13 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.92 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  38.36 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  39.17 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.13 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 303 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.46 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  37.16 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.37 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.37 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  37.74 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 209 aa  131  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  35.5 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 209 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  35.96 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  35.29 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 238 aa  127  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.37 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.37 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  34.65 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  35.48 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.35 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  32.35 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.8 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.07 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.12 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.49 
 
 		 213 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>