More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2364 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  67.53 
 
 
231 aa  327  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  64.5 
 
 
231 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  66.38 
 
 
229 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 
238 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  56.72 
 
 
238 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  57.4 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 
234 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  54.58 
 
 
237 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  54.51 
 
 
231 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  50.86 
 
 
245 aa  224  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  51.08 
 
 
246 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  49.8 
 
 
256 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  49.34 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  51.3 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  49.79 
 
 
231 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.42 
 
 
226 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  52.27 
 
 
222 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  52.27 
 
 
222 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  52.27 
 
 
222 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 
232 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 
225 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  47.27 
 
 
246 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  46.26 
 
 
225 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  42.66 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  43.81 
 
 
205 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
210 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 
210 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.47 
 
 
211 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
209 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
209 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  38.36 
 
 
206 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
205 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 
206 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.9 
 
 
206 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
209 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
212 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.57 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.03 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 
216 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.87 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.92 
 
 
201 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  41.31 
 
 
219 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  43.12 
 
 
222 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 
213 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.79 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.79 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 
215 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
215 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.79 
 
 
215 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
212 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
213 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 
211 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
198 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 
208 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
215 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
214 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.18 
 
 
208 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
215 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
215 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
215 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.82 
 
 
207 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 
217 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
215 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.09 
 
 
215 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
215 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
215 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 
209 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 
208 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 
207 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  36.57 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  35.27 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>