More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  58.8 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  55.6 
 
 
238 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 
238 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  50.65 
 
 
231 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  51.3 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  50.64 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  52.38 
 
 
229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  48.07 
 
 
237 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
231 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  48.07 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  48.7 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  47.21 
 
 
224 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 
256 aa  191  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  45.99 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  44.73 
 
 
245 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  45.02 
 
 
225 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 
225 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  40.85 
 
 
246 aa  164  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  44.92 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  44.92 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  44.92 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.65 
 
 
226 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 
225 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 
233 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  41.87 
 
 
238 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
205 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.07 
 
 
201 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.91 
 
 
211 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
214 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
214 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.34 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.4 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  34.5 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
212 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  34.62 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  36.52 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.5 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  39.63 
 
 
265 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 
222 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
212 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 
216 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
209 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 
218 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
240 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 
213 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 
214 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 
215 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
209 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  35.47 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.91 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.18 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 
213 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 
207 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 
218 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  32.76 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  31.91 
 
 
221 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
214 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.3 
 
 
214 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.44 
 
 
215 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  33.62 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
213 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 
206 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
209 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
213 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.53 
 
 
209 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  32.61 
 
 
213 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  32.48 
 
 
222 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
209 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  33.19 
 
 
214 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
209 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 
483 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
209 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
218 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
221 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
215 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
209 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  31.74 
 
 
241 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
219 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.03 
 
 
208 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
209 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  34.48 
 
 
215 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>