More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3655 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
216 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.8 
 
 
214 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0988  metallo-beta-lactamase family protein  36.32 
 
 
214 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  40.39 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 
210 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  36.19 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
210 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.71 
 
 
209 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40.8 
 
 
217 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  36.49 
 
 
215 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
219 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  40.8 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  35.45 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  37.14 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  36.06 
 
 
222 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  39.91 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.38 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  34.3 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
210 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  36.1 
 
 
212 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  34.3 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.6 
 
 
214 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
240 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  34.43 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
238 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.45 
 
 
207 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.74 
 
 
237 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
218 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
214 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 
238 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 
216 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 
218 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  33.18 
 
 
241 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 
212 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
216 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  36 
 
 
224 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
208 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
214 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 
214 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 
207 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
214 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
231 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
214 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  33.96 
 
 
214 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 
218 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
213 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  36.06 
 
 
230 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
215 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 
212 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
213 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 
213 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
214 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  36.27 
 
 
213 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
218 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  33.49 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.27 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  36.87 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>