More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2186 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  56.8 
 
 
209 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  56.37 
 
 
208 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  54.23 
 
 
208 aa  225  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  53.62 
 
 
210 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 
208 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.34 
 
 
214 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41.87 
 
 
208 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 
209 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 
209 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
215 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
207 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
214 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  40 
 
 
213 aa  144  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
251 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 
214 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.86 
 
 
207 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
216 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.97 
 
 
214 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
211 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.61 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.06 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
209 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
209 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  35.55 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
209 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.55 
 
 
213 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
209 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
209 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 
212 aa  131  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
210 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  37.68 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  36.74 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 
209 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 
218 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.71 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.86 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
205 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  32.43 
 
 
214 aa  124  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
213 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
201 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
210 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  38.28 
 
 
216 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
215 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  35.94 
 
 
230 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  37.19 
 
 
210 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
213 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
215 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  37.87 
 
 
256 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 
213 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 
212 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  37.04 
 
 
212 aa  121  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  36.32 
 
 
217 aa  121  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 
218 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  33.8 
 
 
213 aa  121  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
214 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.95 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.09 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
214 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 
215 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  37.09 
 
 
218 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  35.41 
 
 
214 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>